Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms