Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms