Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms