Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms