Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms