Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms