Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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