Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms