Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms