Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CRYBA4P53673 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms