Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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