Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms