Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VEGFBP49765 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms