Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms