Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms