Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms