Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CASQ1P31415 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CASQ1P31415 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CASQ1P31415 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CASQ1P31415 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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