Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms