Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTFP26441 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms