Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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