Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms