Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNB1P20700 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms