Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HOXB4P17483 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HOXB4P17483 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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HOXB4P17483 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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HOXB4P17483 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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