Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms