Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms