Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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