Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IL3P08700 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL3P08700 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL3P08700 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL3P08700 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL3P08700 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL3P08700 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL3P08700 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL3P08700 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL3P08700 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3P08700 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3P08700 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms