Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBP07199 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBP07199 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms