Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPLNO95428 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms