Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC2O95409 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms