Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JRKO75564 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
JRKO75564 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JRKO75564 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JRKO75564 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JRKO75564 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JRKO75564 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JRKO75564 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JRKO75564 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms