Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms