Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms