Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms