Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC28A2O43868 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms