Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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