Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms