Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms