Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms