Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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