Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIAS3Q9Y6X2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms