Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GIT1Q9Y2X7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIT1Q9Y2X7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms