Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC5Q9UQL6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC5Q9UQL6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms