Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms