Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms