Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms