Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms