Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms