Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms