Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms